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arcticzymes Cod UNG說明書

更新時間:2020-06-18      點擊次數:2107

 

arcticzymes Cod UNG說明書

Cod Uracil-DNA Glycosylase

鱈魚尿嘧啶-DNA糖基化酶

來自大西洋鱈魚的鱈魚尿嘧啶-DNA糖基化酶(Cod UNG)是通過中度熱處理*不可逆地滅活的UNG酶。該酶在含有修飾的Cod UNG基因的重組大腸桿菌(ung-)菌株中產生。

圖片

高魯棒性

不耐熱,在55°C時*不可逆轉地失活

圖片

污染控制

RT-PCR,RT-qPCR,qPCR和kPCR中污染控制的理想選擇

圖片

PCR后分析

啟用PCR后分析

 

 

真正的不耐熱尿嘧啶DNA糖基化酶

當今市場上有幾種可商購的尿嘧啶-DNA糖基化酶。如果您不打算在PCR后進一步分析PCR產物,則其中大多數是細菌來源的,效果很好。但是,如果要存儲PCR產物用于下游分析(例如克隆和測序),則UNG的重新激活和隨后PCR產物的降解是大多數商用UNG的問題。來自ArcticZymes的Cod UNG是當今一種可*加熱且不可逆地失活的UNG。

該圖顯示了一個*不可逆轉地被熱滅活的UNG是Cod UNG

圖1.*,不可逆地熱滅活的UNG是Cod UNG。

如圖1所示,其中測試了各種UNG在熱滅活后的殘留活性。用dUTP和1個單位的5種不同的市售UNGs進行PCR。PCR后,將PCR產物在室溫下孵育各種時間間隔,然后加熱并隨后冷卻。PCR產物的凝膠電泳顯示UNG重新活化,因此,除了Cod UNG外,所有測試的所有UNG的PCR產物都嚴重降解。

 

圖2.用1 U Cod UNG(A)或1 U E.coli UNG(B)預處理并在室溫下孵育3小時的測序PCR產物的色譜。只有Cod UNG保留序列質量不變。

通過對PCR產物進行測序,進一步評估了PCR后序列的質量和完整性。用添加到預混物中的四種不同的市售UNG之一進行PCR。PCR后,將PCR產物在室溫或4°C下以不同的時間間隔孵育。隨后將樣品純化并測序。*分析了序列數據,重點是由于UNG重新激活而降低了序列質量。如圖2和圖3所示,用UNG處理的樣品,除用Cod UNG處理的樣品外,由于UNG的再活化而顯示出嚴重的PCR產物降解。

0h6h24hControlCod UNGSupplier ASupplier BSupplier C0100200300400500600700800900Amplicon length (bp)

 0小時6小時24小時
控制789779774
鱈魚781785785
供應商A78478666
供應商B79248 
供應商C801221 

圖3. UNG重新激活導致序列降解。經各種UNG預處理并在室溫下孵育的PCR產物的序列數據。除與Cod UNG一起溫育的樣品外,所有樣品均顯示UNG的重新活化和PCR產物的嚴重降解。

聚合酶鏈反應

Cod UNG適用于所有市售的預混料。確保在先前的PCR實驗中使用了包含dNTP混合物的dUTP。

  • 將0.25 U Cod UNG直接添加到25 µl PCR反應中
  • 在室溫下預孵育5分鐘
  • 運行PCR

在分析之前,將PCR產物在-20°C或4°C的溫度下保存盡可能長的時間。

一站式RT-PCR

  • 將0.2 U Cod UNG直接添加到您的20 µl RT-PCR反應中
  • 在室溫下預孵育5分鐘
  • 在50- 55°C下逆轉錄您的RNA
  • 運行PCR

 

物產

Cod UNG適用于所有市售的預混料。確保在先前的PCR實驗中使用了包含dNTP混合物的dUTP。

  • 將0.25 U Cod UNG直接添加到25 µl PCR反應中
  • 在室溫下預孵育5分鐘
  • 運行PCR

在分析之前,將PCR產物在-20°C或4°C的溫度下保存盡可能長的時間。

 

 

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